Charles R. Darwin, Beagle gezisi sonrası düşünce dünyasını evrimin meydana gelmiş olduğuna inandırdı. Diğer bir taraftan
ise, kendisinin doğal seçilim kuramı yaşamı boyunca popülerlik kazanamadı. Günümüze kadar evrim gerçeği bilimin merkezinde yer almasına rağmen, Darwin ve evrim sıkça yanlış anlaşılmakta, yanlış alıntılanmakta ve yanlış uygulanmaktadır. Fakat Darwin’in evrim kuramı bazı inceliklere ve ek koşullara sahiptir. Beagle gezisinin ardından Darwin, gözlemleriyle ilgili notlarını yazmaya başlamıştır. Pek çok bilim insanının düşüncelerinden etkilenerek doğaya dair yeni gözlemlemeler ve bunlar sonucunda yeni çıkarımlar yapmıştır. Türlerin Kökeni Üzerine (On The Origin of The Species) adlı kitabıyla canlıların ortak atadan evrilerek türediği fikrinin geniş kitleler tarafından kabul görmesini sağlamıştır.
Beagle gezisinin ardından Henslow, Darwin’ in jeoloji hakkındaki mektuplarının bir kitapçığını bazı doğa bilimcilerine vererek, ilk öğrencisinin itibarını herkese göstermiştir. Henslow’un sayesinde Darwin’in ünü bilim dünyasında yayılmıştır. Darwin, Beagle gezisi dönüşü sonrası Shrewsbury’deki evini ziyaret etmiştir, akrabalarını görmüştür. Ardından, Henslow’u görmek için Cambridge’ye gitmek için yola koyulmuştur. Henslow, bitki türlerinin sınıflandırılması üzerine Darwin’e yardımcı olmuştur. Hayvan örnekleri için zoologlara ihtiyaç duymuştur. Darwin’in babası, Darwin’in iyi bir bilim adamı olabilmesi için ona yatırım yapmıştır. Bu nedenle babasının mali desteğiyle Londra’dan birkaç zoologla görüşmeye başlamıştır. Sonrasında Charles Lyell’in vesilesiyle Richard Owen adlı bir biyologla tanışmıştır. Owen, Darwin’in topladığı fosil kemikler üzerinde çalışmaya başlamıştır. Bu sayede pek çok soyu tükenmiş olan hayvan türünü tanımlamıştır. Bu türlerin arasında tembel hayvanlar (Scelidotherium), su aygırı benzeri bir otobur memeli (Toxodon) ve armadillo benzeri dev bir zırhlı memeli (Gliptodon) da vardı. Anatomik açıdan bu ise, kendisinin doğal seçilim kuramı yaşamı boyunca popülerlik kazanamadı. Günümüze kadar evrim gerçeği bilimin merkezinde yer almasına rağmen, Darwin ve evrim sıkça yanlış anlaşılmakta, yanlış alıntılanmakta ve yanlış uygulanmaktadır. Fakat Darwin’in evrim kuramı bazı inceliklere ve ek koşullara sahiptir. Beagle gezisinin ardından Darwin, gözlemleriyle ilgili notlarını yazmaya başlamıştır. Pek çok bilim insanının düşüncelerinden etkilenerek doğaya dair yeni gözlemlemeler ve bunlar sonucunda yeni çıkarımlar yapmıştır. Türlerin Kökeni Üzerine (On The Origin of The Species) adlı kitabıyla canlıların ortak atadan evrilerek türediği fikrinin geniş kitleler tarafından kabul görmesini sağlamıştır.
Beagle gezisinin ardından Henslow, Darwin’ in jeoloji hakkındaki mektuplarının bir kitapçığını bazı doğa bilimcilerine vererek, ilk öğrencisinin itibarını herkese göstermiştir. Henslow’un sayesinde Darwin’in ünü bilim dünyasında yayılmıştır. Darwin, Beagle gezisi dönüşü sonrası Shrewsbury’deki evini ziyaret etmiştir, akrabalarını görmüştür. Ardından, Henslow’u görmek için Cambridge’ye gitmek için yola koyulmuştur. Henslow, bitki türlerinin sınıflandırılması üzerine Darwin’e yardımcı olmuştur. Hayvan örnekleri için zoologlara ihtiyaç duymuştur. Darwin’in babası, Darwin’in iyi bir bilim adamı olabilmesi için ona yatırım yapmıştır. Bu nedenle babasının mali desteğiyle Londra’dan birkaç zoologla görüşmeye başlamıştır. Sonrasında Charles Lyell’in vesilesiyle Richard Owen adlı bir biyologla tanışmıştır. Owen, Darwin’in topladığı fosil kemikler üzerinde çalışmaya başlamıştır. Bu sayede pek çok soyu tükenmiş olan hayvan türünü tanımlamıştır. Bu türlerin arasında tembel hayvanlar (Scelidotherium), su aygırı benzeri bir otobur memeli (Toxodon) ve armadillo benzeri dev bir zırhlı memeli (Gliptodon) da vardı. Anatomik açıdan bu hayvanlar, Darwin’in düşündüğü gibi Afrika hayvanların değil, Güney Amerika hayvanlarına daha benzerlik göstermiştir.
Darwin, 1836 yılında uniformitarianizm düşüncesi doğrultusunda Güney Amerika kıtasının yükseldiğine dair bir bilimsel makale yazmıştır. Lyell’in onayıyla beraber bu makalesini Londra Jeoloji Cemiyeti’ne sunmuştur.
Bununla beraber, Beagle gezisinde topladığı kuş ve memeli örneklerini de Londra Zooloji Cemiyeti’ne sunmuştur. John Gould adında bir ornitolog, Darwin’in tanımlayamadığı ve değişik türlere ait olduğunu düşündüğü bir grup kuşun aslında birbirlerine çok yakın 12 yeni ispinoz türü olduğunu izah etmiştir. Bunun sonrasında Darwin, Lyell’in uniformitaryanist fikirlerinden etkilenerek türlerin coğrafik kalıntı halinde yerde katmanlar oluşturduğunu açıklamıştır.
hayvanlar, Darwin’in düşündüğü gibi Afrika hayvanların değil, Güney Amerika hayvanlarına daha benzerlik göstermiştir.